جامعة الأقصى مؤسسة حكومية مستقلة علمياً وأكاديمياً، يشرف عليها مجلس أمناء مستقل يقرر سياساتها ويتحمل مسؤولياتها. ووفقاً لقانون التعليم العالي رقم (6) لعام 2018 والأنظمة الصادرة بمقتضاه عن وزارة التربية والتعليم العالي تهدف الجامعة إلى نشر المعرفة، وتعميق جذورها، وخدمة المجتمع الفلسطيني وتطويره في إطار فلسفة تستند إلى المفاهيم الوطنية وتراث الحضارة العربية والإسلامية.
بدأت جامعة الأقصى سنة 1955 كمعهد للمعلمين تحت إدارة الحكومة المصرية، وكان الهدف آنذاك هو إعداد المعلمين وتأهيلهم. وفي عام 1991 تطور المعهد إلى كلية، عرفت بكلية التربية الحكومية. ومن حينها أخذت الكلية تتنامى شيئاً فشيئاً في خططها التعليمية، وأقسامها العلمية، وأساتذتها، وطلابها. وخرّجت كثيراً من المدرسين والباحثين أصحاب الكفاءة العلمية والتربوية العالية من حملة البكالوريوس والليسانس والدكتوراه، عبر برنامج الدراسات العليا المشترك مع جامعة عين شمس. ومع بداية العام الجامعي 2000/2001 تم تحويل الكلية إلى جامعة الأقصى.
تضم الجامعة حالياً عشر كليات، هي: كلية العلوم التطبيقية، وكلية الآداب والعلوم الإنسانية، وكلية التربية، وكلية الإعلام، وكلية الفنون، وكلية الإدارة والتمويل، وكلية التربية البدنية والرياضة، وكلية الحاسبات وتكنولوجيا المعلومات، وكلية العلوم الطبية، وكلية مجتمع جامعة الأقصى للدراسات المتوسطة، مع العلم بأن جامعة الأقصى هي الجامعة الوحيدة في قطاع غزة التي تمنح درجة البكالوريوس في تخصصات الإعلام والفنون والتربية البدنية والرياضة.
لعبت الجامعة – منذ تأسيسها – دوراً محورياً في تأهيل وتنمية القدر الأكبر من موارد ومصادر المجتمع المحلية، ولاسيما البشرية منها، وذلك عبر ما تقدمه الجامعة من برامج تعليمية بحثية وتدريبية متخصصة في حقول تكنولوجيا المعلومات والعلوم، وعلى صعيد السياسة والإدارة والاقتصاد وفي مجالات التربية وإعداد المعلمين وفي حقول الإعلام والرياضة. كل ذلك لخدمة المجتمع الفلسطيني والمساهمة في تطوره الاقتصادي والاجتماعي.
والجامعة موجود في مدينة غزة، ومدينة خانيونس.
فرع غزة:
يقع الحرم الجامعي في منطقة الرمال الجنوبي بغزة إلى الجنوب من مباني رئاسة الوكالة وشرقاً من حرم الجامعة الإسلامية، يحده من الغرب شارع مصطفى حافظ.
تبلغ مساحة فرع الجامعة بغزة حوالي 17.9 دونماً، ويضم الحرم مبانيَ ومرافق وخدمات ومساحات خضراء ومواقف سيارات تتخللها شوارع للحركة.
يضم الحرم 7 مبانٍ تتنوع ما بين مباني القاعات الدراسية والمباني الإدارية والخدماتية.
فرع خانيونس:
يقع الحرم الجامعي في منطقة المواصي غرب مدينة خانيونس بالقرب من مدينة أصداء للإنتاج الإعلامي.
تبلغ مساحة فرع الجامعة بغزة حوالي 238.4 دونماً، ويشمل الحرم على مباني ومرافق وخدمات ومساحات خضراء ومواقف سيارات وملاعب مفتوحة تتخللها شوارع للحركة.
يضم الحرم 24 مبنى تتنوع بين مباني القاعات الدراسية والمباني الإدارية والخدماتية.
كلية مجتمع الأقصى بخانيونس:
يقع حرم كلية مجتمع الأقصى في مدينة خانيونس البلد، وتبلغ مساحة الكلية في غزة حوالي 1.65 دونم، ويضم الحرم مبانيَ ومرافق وخدمات ومساحات خضراء تتخللها شوارع للحركة. كما يضم حرم الكلية مبنى القاعات الدراسية وورش الصيانة والكافتيريا.
كلية مجتمع الأقصى بغزة:
يقع الحرم الجامعي في مدينة خانيونس، وتبلغ مساحة الكلية في غزة حوالي 5.4 دونم، ويضم الحرم مبانيَ ومرافق وخدمات ومساحات خضراء ومواقف سيارات تتخللها شوارع للحركة. يضم الحرم مبني القاعات الدراسية ومبنى الكافتيريا والمكتبة.